1、原辅料要求
用来栽培袋料香菇的原料和辅料要求优质、新鲜，坚决不使用假劣变质的麦麸和石膏、红糖等。同时，原辅材料在贮藏期间，应妥善保存，随时检查，防止霉烂变质。
2、菌种选择
接种时选用的菌种菌龄以45-55天的为宜，壮龄菌种萌发力和抗杂菌侵染力都比较强。品种则要选择抗逆性强、出菇率高、菇品优质的菇种。
3、水分调配
香菇培养料木屑、麸皮、石膏按照79：20：1的比例进行调配，含水量控制在55％-60％，pH值控制在6-7左右。高温季节制棒可适当降低培养料含水量，以降低菌棒污染率。
4、做好灭菌
菌棒灭菌不彻底，就易导致杂菌得以滋生扩散。因此，可先将栽菌棒放入灭菌蒸笼，密封严实，保温前底部四个角的排气孔应打开，让水蒸气将灶内或罩膜内的冷空气排出。当整个灶内都充满蒸汽，下部空间温度达到97至100℃时，保温12至16小时，即可彻底灭菌。
5、正确接种
接种场所要用甲醛溶液等彻底消毒。消毒完成后立即进行接种作业，接种箱用灭菌烟剂熏蒸30分钟后，实现无菌环境。接种人员的身体、工具要进行消毒处理。接种完成立刻套外袋，防止杂菌污染。
6、坏棒处理
经常检查菌棒，发现霉菌污染要及时在霉菌点注射克霉灵，杀灭杂菌的同时又不影响菌丝生长。若菌棒污染比较严重，则应及时捡出处理，远离发菌棚深埋，并对污染严重的地面撒石灰处理。
总的来说，要想有效防止香菇菌棒的杂菌污染，需从原材料到菌棒发菌成功后为止，都得严格控制污染源，并做好消毒灭菌等工作。而即便菌棒已经长了杂菌也没关系，需及时发现杂菌，并正确处理杂菌。
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